List the selected values in an array in PHP, AngularJS and MySQL

I want to list the data in checkbox by enabling select through AngularJS and PHP.

I leave the codes:

app.js:

    $scope.getPhase0 = function(){
    var dataSend = {
      "service": "getPhase0",
      "token": token
    };
    Connect.post(service_api,dataSend,function(data){
      $scope.phase0 = data;
      $scope.producto = data[0].phase0_name;
      $scope.fecha = data[0].phase0_date;
      $scope.descripcion = data[0].phase0_descripcion;
      $scope.chile = data[0].phase0_chile;
      $scope.peru = data[0].phase0_peru;
      $scope.bolivia = data[0].phase0_bolivia;
      $scope.colombia = data[0].phase0_colombia;
      $scope.ecuador = data[0].phase0_ecuador;
      $scope.paraguay = data[0].phase0_paraguay;
      $scope.otros = data[0].phase0_otros;
      $scope.total = data[0].phase0_total;
      $scope.internacional = data[0].phase0_internacionales;
      $scope.nacional = data[0].phase0_nacionales;
      $scope.innovacion = data[0].phase0_innovacion;
      $scope.aplicacion = data[0].phase0_aplicacion;
      $scope.caracteristica = data[0].phase0_caracteristica;
      $scope.proliferacion = data[0].phase0_proliferacion;
      $scope.presentado = data[0].phase0_presentado;
      $scope.gerente = data[0].phase0_gerente;
      var especies = data[0].phase0_especies;
      var arrespecies[] = especies.split(',');
      console.log("Phase0", arrespecies);
      $("input[name='especies[]']").each(function(index, item){
    for($i=0; $i<$scope.arrespecies.length;$i++){
      if(item.value==$scope.arrespecies[$i]){
        $("input[name='especies[]']").attr('checked', true);
      }
    }
  })
    });
  }
})

phase_0.html:

<div class="row">
                    <div class="col-xs-12">
                        <label>Especies destino</label>
                    </div>
                </div>
                <div class="row">
                    <div class="col-xs-12 col-sm-12 col-md-4 col-lg-4">

                        <div class="form-group">
                            <div class="checkbox">
                                <label>
                                    <input name="especies[]" value="1" type="checkbox">
                                    Especie 1
                                </label>
                            </div>

                            <div class="checkbox">
                                <label>
                                    <input name="especies[]" value="2" type="checkbox">
                                    Especie 2
                                </label>
                            </div>

                            <div class="checkbox">
                                <label>
                                    <input name="especies[]" value="3"  type="checkbox">
                                    Especie 3
                                </label>
                            </div>
                        </div>
                    </div>
                    <div class="col-xs-12 col-sm-12 col-md-4 col-lg-4">

                        <div class="form-group">
                            <div class="checkbox">
                                <label>
                                    <input name="especies[]" value="4" type="checkbox">
                                    Especie 4
                                </label>
                            </div>

                            <div class="checkbox">
                                <label>
                                    <input name="especies[]" value="5" type="checkbox">
                                    Especie 5
                                </label>
                            </div>

                            <div class="checkbox">
                                <label>
                                    <input name="especies[]" value="6"  type="checkbox">
                                    Especie 6
                                </label>
                            </div>
                        </div>
                    </div>
                    <div class="col-xs-12 col-sm-12 col-md-4 col-lg-4">

                        <div class="form-group">
                            <div class="checkbox">
                                <label>
                                    <input name="especies[]" value="7" type="checkbox">
                                    Especie 7
                                </label>
                            </div>

                            <div class="checkbox">
                                <label>
                                    <input name="especies[]" value="8" type="checkbox">
                                    Especie 8
                                </label>
                            </div>

                            <div class="checkbox">
                                <label>
                                    <input name="especies[]" value="9"  type="checkbox">
                                    Especie 9
                                </label>
                            </div>
                        </div>
                    </div>
                </div>

services.php:

function getPhase0($mysqli){
    $ret = [];
    $query_comment = "SELECT phase0.* FROM ".$GLOBALS['base_table'].".phase0";
    if($phase0 = $mysqli->query($query_comment)) {
        $ret = $phase0->fetch_all(MYSQLI_ASSOC);
    };
    return $ret;
}